Catedrático de clavecín del Conservatorio Superior de Música de Castellón y organista de la Catedral de Valencia, Pablo Márquez Caraballo cursa lo estudios de órgano, clavecín, música antigua y composición en los conservatorios de Valencia, Toulouse, Ámsterdam y la Haya, con los profesores Michel Bouvard, Jan Willem Jansen, Pieter van Dijk, Fabio Bonizzoni, Patrick Ayrton i Ton Koopman. Durante estos años ha sido premiado con las becas del Instituto Valenciano de la Música y con la Huygens Scholarship Programme del Ministerio de Educación Holandés.
Ha sido ganador de varios concursos de órgano y composición, entre los que cabe destacar el Concurso Internacional de Órgano “Buxtehude”, celebrado en Lübeck (Alemania). Así mismo, ha ofrecido numerosos conciertos de órgano y clave como solista y como integrante de agrupaciones camerísticas y orquestales en Europa, EE.UU. y Japón, teniendo la oportunidad de participar en los festivales más importantes y de tocar en numerosos instrumentos históricos. En 2012 forma el dúo “Concertante a quattro” con su mujer, la organista japonesa Atsuko Takano, con quien ha realizado varias giras por España, Portugal, Suiza, Holanda, Alemania y Japón. En 2018 funda el Cabanilles Consort, grupo especializado en la interpretación históricamente informada de la música española y europea de los siglos XVII y XVIII.
En septiembre de 2017 consiguió el grado de doctor en historia por la Universitat de València con la defensa de su tesis doctoral “Historia de los órganos de la catedral de Valencia durante los siglos XVI-XXI. Historia y evolución”, con la calificación de sobresaliente “cum laude”. Entre sus ponencias destaca la realizada en la Cornell University de New York sobre la influencia de la organería valenciana en la obra orgánica de Joan Cabanilles. Sus investigaciones le han conducido a colaborar como experto en restauraciones de instrumentos históricos. Entre 2017-2020 ocupó la catedral de clavecín en el Conservatorio Superior de Música de Valencia. En la actualidad compagina la docencia e investigación con una intensa actividad concertística internacional.